SARS-CoV-2 взаимодействует с необычными структурами РНК в клетках человека

Международная группа исследователей показала, что домен белка (Nsp3) тяжелого острого респираторного синдрома коронавируса 2 (SARS-CoV-2) взаимодействует с необычными структурами дезоксирибонуклеиновой кислоты (ДНК) и рибонуклеиновой кислоты (РНК), называемыми G-квадруплексами или G4.


Исследование, опубликованное в журнале Nucleic Acids Research , продемонстрировало, что лиганды G4, химическое вещество, связывающееся с G4, предотвращают это взаимодействие. Результаты могут проложить путь к разработке ингибиторов этих взаимодействий в качестве потенциальных противовирусных соединений.

В текущем исследовании исследователи из Института Пастера (Institut Pasteur), Политехничесой школы (Ecole Polytechnique), Института Кюри (Institut Curie), Inserm, CNRS и университетов Парижа, Париж-Сакле, Бордо и Тулузы решили выяснить, присутствует ли домен SUD в равной степени в SARS. -CoV-2 Nsp3. Если этот домен присутствует, команда стремилась проанализировать его способность связывать G4 и посмотреть, могут ли эти взаимодействия модулироваться G4-лигандами.

Исследование показало, что белок Nsp3 SARS-CoV-2 содержит домен SUD, который взаимодействует со специфическими ДНК и РНК G4, но не с предполагаемыми G4, предсказанными в геноме SARS-CoV-2. Команда также обнаружила, что эти взаимодействия могут быть нарушены мутациями, препятствующими сворачиванию олигонуклеотидов в структуры G4, и лигандами G4.


результаты исследования открывают путь для дальнейших исследований роли взаимодействий SUD / G4 во время репликации SARS-CoV-2. Это дает надежду на разработку профилактических средств, которые могут препятствовать размножению SARS-CoV-2.

Продолжаются эксперименты по определению предпочтительных партнеров SUD-домена SARS-CoV-2, более вероятно, что это информационные РНК (мРНК), кодирующие белки, участвующие в иммунном ответе, стрессовой реакции или воспалении.

Наряду с исследованием исследователи также разработали лиганды G4. Они продемонстрировали, что эти лиганды, которые препятствуют взаимодействиям между белком SARS-CoV-2 и структурой G4, вызывают противовирусную активность. Следовательно, эти структуры могут быть использованы в терапии для борьбы с текущей пандемией.

По состоянию на 26 июля 2021 года вирус поразил 192 страны и территории. Среди них США сообщают о наибольшем количестве случаев, превысив 34,5 миллиона случаев, за ними следуют Индия и Бразилия с более чем 31,41 миллиона и 19,7 миллиона случаев соответственно.

Несмотря на то, что было введено более 3,87 миллиарда доз вакцины, многие страны по-прежнему сообщают о росте случаев заболевания, вызванном появляющимися вариантами SARS-CoV-2. Поэтому, помимо вакцин, крайне важно разработать терапевтические средства для профилактики и лечения COVID-19.